第六批可再生能源补贴目录下发仅半年，几乎所有电站都拿到了拖欠的补贴，但只拿了一部分；而此前的第五批可再生能源补贴目录中的电站也于近期出现了部分补贴缺口。
补贴资金不足：可再生能源附加拖欠严重
根据光伏們此前报道，第五批进入可再生能源补贴的光伏电站项目补贴缺口约为100亿元左右，该部分缺口后来由财政部单独拨付资金进行补齐，而第六批的补贴缺口目前还没有着落。
可再生能源补贴资金的缺口还将持续增长。国家发改委能源研究所研究员时璟丽此前在一次论坛中提到他们做过的测算：如果考虑到风电在2020年能够在部分地区实现跟煤电平价竞争、光伏发电在用户侧实现平价上网，以及可再生能源电价附加水平不变的情况下，仅2020年当年补贴资金的需求就将达到1800亿元，而可征收的电价附加补贴资金仅1100亿元，因此2020年当年就存在700亿元的补贴资金缺口。
按照时璟丽的推算，在现状不变的情况下，光伏們预计到2020年补贴资金缺口累积将达到2000亿左右，而这个窟窿将由可再生能源投资企业来承担，然后可再生能源投资企业甚至会通过拖欠供应商的资金来缓解现金流压力，最终导致可再生能源行业的恶性发展。
可再生能源补贴资金少了500多亿，“罪魁祸首”是他们
2016年1月，财政部、国家发改委发布了《关于提高可再生能源发展基金征收标准等有关问题的通知》，明确可再生能源电价附加自2016年1月1日起标准由1.5分/Kwh提高到1.9分/Kwh。同时强调，要切实加强企业自备电厂等基金征收管理，各地不得擅自减免或缓征。
2016年9月，《可再生能源法》正式实施十周年，在十周年研讨会上，国家发改委价格司电力处相关人士介绍道，按照文件，2016年征收的可再生能源附加基金应达到800亿元，这与可再生能源需要的补贴资金数额基本相符，但实际上征收的数额远低于该数字，这也是导致补贴无法及时到位的重要原因之一。
根据国家发改委能源研究所的反推数据，“十二五”期间自备电厂拖欠的可再生能源电价附加约为400亿元。由此，截至目前，企业自备电厂截至目前累计拖欠的可再生能源电价附加或将超过500亿元。
根据中电联数据2015年可再生能源附加征收对象第二、第三产业合计总用电量为47204亿Kwh，按照当年征收标准1.5分/Kwh，2015年合计应该征收到的可再生能源电价附加为708亿元，但实际上根据国家财政部公布的2015年全国政府性基金收入决算表显示，可再生能源电价附加收入决算数为514.87亿元。当然，这部分的差额不排除还有自备电厂之外的因素，但大部分的拖欠皆来自于自备电厂。
根据一份最近数据显示，目前国内自备电厂装机约为12592万千瓦，每年发电量6084亿千瓦时，按照1.9分/Kwh的征收标准，这部分可再生能源电价附加征收为115.6亿元。即使是打折之后的基金数额对于可再生能源拖欠的补贴也是一笔“巨款”。
另外，根据知情人透露，2016年某自备电厂的年利用小时数高达7000小时，而根据中电联统计数据，2015年全国6000千瓦及以上电厂发电设备平均年利用小时数为3969小时。由于自备电厂效益较好，正有越来越多的电厂开始转向自备电厂模式，这对于可再生能源电价附加的征收可谓是雪上加霜。
实际上，自备电厂需要缴纳的政府性基金不仅限于可再生能源电价附加，诸如三峡工程建设基金、农网还贷资金、城市公用事业附加费、可再生能源电价附加以及水库移民后期扶持资金等需要自备电厂缴纳的政府性基金也拖欠严重。
